巧克力囊腫穿刺的費用大約需要3000-4000元左右，不同的醫院收費會有所不同，不同的地區收費標準也會有所差異。一般情況下，巧克力囊腫術前要常規進行一些檢查，要行彩超檢查，瞭解囊腫的大小以及位置；行白帶檢查，瞭解有無陰道的炎症；行血常規檢查、傳染病的檢查、心電圖的檢查以及凝血四項的檢查。如果檢查沒有異常，巧克力囊腫是在超導監測下行囊腫的穿刺手術，事先要設計好穿刺路徑，避開腹腔的大血管以及腸管。

一般情況下巧克力囊腫囊內都是血液，淤積的血液抽取後容易造成黏稠，所以需要反覆的沖洗抽吸，抽吸乾淨後注入無水酒精硬化。無論是腹腔鏡下的囊腫剝除手術，或者是開腹的囊腫剝除手術，都存在復發的幾率，所以可以行巧克力囊腫的穿刺手術，更加微創。術後要注意休息一個月，避免重的體力勞動，注意衛生，加強營養，一個月後要到醫院行彩超檢查。