存在卵巢巧克力囊腫，如果囊腫的直徑比較小，小於3cm，而且臨床症狀比較輕，只是輕度的腹痛，這種情況可以正常的備孕，因為卵巢巧克力囊腫體積比較小，對卵巢功能的影響相對比較小，基本排卵是正常，建議積極的備孕，在懷孕期間，由於不來月經，卵巢巧克力囊腫也有可能逐漸的萎縮。

如果卵巢巧克力囊腫的直徑大於5cm，這種情況對卵巢的破壞能力相對比較大，影響排卵，就需要手術將卵巢巧克力囊腫切除，這樣才能恢復正常的懷孕，可以選擇腹腔鏡微創手術，在身體的表面打3-4個洞，應用特殊的儀器將卵巢巧克力囊腫切除，對身體的損害性小恢復的快。