胚胎停育與同房是沒有關係的。出現胚胎停育主要的原因是遺傳基因的缺陷，夫妻雙方任何一方有染色體異常都可以傳至子代。如果發生胚胎停育，可進行夫妻雙方的染色體檢查和流產胚胎的染色體檢查，母體患有甲狀腺功能低下、慢性腎炎、高血壓、嚴重貧血、黃體功能不足、懷孕早期受到細菌、病毒感染，都可能導致胚胎停育。

孕早期同房不會導致胎停，孕早期胚胎髮育尚不穩定，如果同房力度過大或頻率過高，容易導致子宮收縮引起先兆流產，孕早期是不建議同房的。出現胚胎停育在下次備孕前要進行全面檢查，必要時需要先進行相關的治療，等孕婦機體的功能恢復後再考慮備孕。