同自然受孕一樣，導致試管嬰兒失敗的原因主要有三個方面，胚胎、子宮內膜、母體，具體內容如下：

1、其中胚胎髮育異常導致妊娠失敗是首要原因。但是通常在進行胚胎移植之後，無法對胚胎髮育情況做進一步追蹤。到底胚胎髮育的潛能如何以及它是否能夠繼續存活，是否能夠成功著床，以及是否能夠繼續發育下去，這一切都是未知；

2、針對子宮內膜來講，相對於胚胎移植也比較重要。子宮內膜相當於胚胎移植著床的土壤，其發育狀況會直接影響到它對胚胎的接受能力。目前評估內膜的容受性指標主要包括超聲檢查，檢查內膜厚度、類型、容積和血流特點。另一方面是內膜組織形態學檢查，以及內膜分子生物學檢查，還有目前比較流行的基因組學檢查，但是臨床上目前常用方法主要是通過B超來檢測內膜厚度、類型和血流來進行評估；

3、對於母體因素來講，主要包括是否患有全身性疾病，如腎炎、高血壓或貧血，以及是否有存在子宮畸形、內分泌異常，以及精神創傷等方面的疾病。