精液異常是個綜合徵，它的原因非常多，並且至少有50%的患者，目前的醫學手段沒有辦法發現原因，稱為特發性精液異常。在可以查到原因的患者裡，常見的是男性精索靜脈曲張、附睪或前列腺慢性炎症，或者是支原體、衣原體、淋球菌方面的感染。還有一些因素，比方說隱睪沒有下降，或者隱睪手術時間過晚、腹股溝疝手術誤傷輸精管等等。