多數腎臟錯構瘤病人沒有臨床表現，部分錯構瘤病人可以表現為腰痛、血尿等。錯構瘤通常屬於良性腫瘤，生長比較緩慢，如果錯構瘤<4cm對腎臟影響較小，臨床密切關注即可。

如果錯構瘤>4cm，可能會對腎臟造成一定壓迫，出現壓迫症狀，如結石增多、腎功能和形態改變、血肌酐升高、尿路感染等。如果錯構瘤>4cm，病人未及時進行手術治療，可能導致錯構瘤破裂、出血甚至導致出血性休克等嚴重情況。