繼發性腺性膀胱炎的治療重點是治療繼發因素。如果由梗阻引起，需治療梗阻；如果由前列腺增生引起，則治療前列腺；如果由結石引起，則需治療結石。治療原發性疾病後，腺性膀胱炎就自然而然得到緩解。

有一類表現為腫塊型腺性膀胱炎，其真正屬於腺性膀胱炎的治療。腫塊型腺性膀胱炎可以經尿道進行膀胱腫塊電切，使腺性膀胱炎得到緩解。同時手術後要用一定量的抗腫瘤藥來抑制腺性膀胱炎的復發，但濾泡型無需使用抗腫瘤藥治療。