陰莖海綿體受損最明顯的表現是出血。如果出現斷裂，會有明顯的出血。伴隨陰莖海綿體出血，會出現陰莖皮膚變黑、變紫。另外還可出現水腫、疼痛等表現。水腫或疼痛的範圍可以擴展到整個陰囊和會陰區，所以陰莖海綿體外傷的診斷相對比較容易。

潛在的陰莖海綿體損傷，如纖維化或輕度挫傷，易被忽視。如最常見的疾病為陰莖海綿體纖維症即佩羅尼氏病，可伴有免疫、感染等因素。進行陰莖海綿體注射的患者，雖然可以增加陰莖海綿體的硬度和勃起時間，但反覆注射可導致陰莖海綿體潛在損傷，如出現陰莖硬結症。因此，關於陰莖海綿體的損傷，應區分是外傷性還是潛在性因素所致。