消化不良處理方式如下：

1、器質性消化不良，如消化性潰瘍、膽囊炎、胰腺炎、結腸炎等，應尋找病因，根據病因治療；

2、功能性消化不良，此類患者雖無器質性病變，但患者可存在腹脹，消化不良等情況，建議從飲食上進行調整，如清淡、規律飲食，避免食用辛辣、油膩、刺激食物，而且避免進食產氣過多的食物，如豆類食物以及纖維素過多的蔬菜，以免加重消化不良。藥物方面可服用消化酶、益生菌，幽門螺桿菌陽性者，需積極進行藥物根除治療。