正常、成功的隱睪手術不影響生育，而對生育恢復起幫助作用。如果不正常的手術，可能損傷到精索、輸精管的組織，損傷睪丸，手術後睪丸萎縮可能容易產生。正常手術對生育有幫助，術後睪丸在正常陰囊裡面，正常溫度下面生長，睪丸會正常生長，後期不育可能性減少。若手術未正常操作，可能在處理鞘狀突時損傷到輸精管，導致影響生育。

部分先天性隱睪，可能合併附睪、睪丸畸形，並非手術損傷。如睪丸、附睪連接長的情況，下面精子輸出時可能產生較大困難，等到成人時，可能嚴重影響自然生育，但可通過人工輔助生育解決。