隱睪手術常規是開放手術，在腹股溝，手術危險性較小，因腹股溝除股動脈、股靜脈外，不會碰到其它臟器，對專科醫生來說是很安全的手術。對特殊的隱睪，如睪丸在腹腔裡或脊柱後方，必須做腹腔鏡下的微創手術，在腹腔裡，風險也較小。

位置很高的睪丸，可能因為睪丸繫帶或動靜脈距離太短，拉不到陰囊裡，要做睪丸移植，這時手術風險較大。睪丸的動靜脈、輸精管吻合需要很高超的技術，吻合不好，一側的睪丸功能喪失。睪丸有產生雄激素和產生精子兩大功能，從上面把睪丸拉到陰囊裡，如距離過短，做睪丸吻合，如果輸精管未吻合，精子就不會產生。如動脈沒有吻合好，睪丸就會萎縮，無法產生雄激素，會造成發育方面或其它生理方面的影響。