隱睪手術後部分患者會發生睪丸萎縮，有的患者認為是手術操作不當引起。其實隱睪手術後睪丸萎縮發生率在5-10%左右。如果患者做過多次手術，則發生睪丸萎縮的幾率相對較高。睪丸萎縮發生率還跟睪丸的狀況有關，如果在手術之前睪丸比較小，術後萎縮的幾率較高。此外，手術之前摸不到的睪丸和手術之前能摸到的正常睪丸相比，發生萎睪丸萎縮的幾率也相對較高。所以隱睪術後的睪丸萎縮是個並不少見的併發症，需要高度重視。