如果冠狀動靜脈瘻導致冠狀動脈直接瘻入右心室、左心室、或左心房、右心房，臨床上會產生較大分流，患兒即會出現症狀，如進行診斷時醫生使用聽診器可以聽到血管雜音。另外，患者因為分流影響，經常出現感冒、肺炎或心衰。通過檢查能夠確診此種疾病，如進行CT血管增強檢查，在血管裡面注射造影劑，同時進行CT檢查，可以充分顯示血管短路和交通位置，從而達到精確定位診斷。