結腸炎和潰瘍性結腸炎的區別在於結腸炎為廣泛的概念，目前臨床不再使用這樣的診斷概括疾病的過程，而潰瘍性結腸炎為特異性的診斷，是指少見的大腸慢性非特異性的炎症疾病過程。結腸炎包括較多疾病，感染性疾病，比如細菌性痢疾、產毒的大腸桿菌感染、腸道結核，以及腸道的特殊病原微生物的感染。還有非感染性的腸道炎症疾病，比如放射性結腸炎、缺血性的結腸炎等，都可以囊括在結腸炎的大概念下。但目前可以分類的疾病，都進行細緻的分類，因為診斷、治療手段不同。

潰瘍性結腸炎是在結腸炎症中特殊的疾病，在診斷和治療過程中，需要謹慎。臨床醫生在診斷潰瘍性結腸炎過程中，需要結合臨床症狀、內鏡表現、組織病理學檢查，以及長時間的隨訪觀察，符合者才做潰瘍性結腸炎的最終判定。