潰瘍性結腸炎40年後的惡變率，明顯高於健康人。國外數據表明，10%-15%的潰瘍性結腸炎患者，最後死於結腸癌。潰瘍性結腸炎8-10年發生的惡變率是2%-3%，10-15年上升到6%-8%，在15年以上，數據從8%到15%-16%。隨著疾病的延長，結腸癌在潰瘍性結腸炎患者當中，發病率明顯上升。

以上的前提條件，是反覆發作的患者，結腸癌的發病率才會增高。研究發現，當炎症被較好的控制，沒有出現反覆發作的患者，比病情遷延反覆發作的患者，發生癌變率要低。所以潰瘍性結腸炎患者，一定要規範治療，讓炎症得到充分控制，達到治療的目標。患者得到臨床緩解，在內鏡下也恢復正常，結腸癌的發病率就會得到降低。