女性結腸炎的典型症狀除了消化道症狀，包括腹痛、腹瀉、便血、黏液便等，還經常有全身症狀，如乏力、貧血、心悸、失眠，有時有食慾減退、噁心、嘔吐等症狀。結腸炎包括單純性結腸炎、特異性結腸炎，男性和女性結腸炎的症狀有差別。結腸炎通常表現為兩側腹和下腹部症狀，包括腹痛、腹瀉、納差、噁心、嘔吐，甚至還有直腸、肛門墜脹感，便血、黏血便等。因為女性盆腔器官還包括子宮、卵巢、附件等，所以相應器官的疾病要跟結腸炎相鑑別。

女性結腸炎和其它婦科疾病相比，主要是有消化道表現。而卵巢、子宮、盆腔炎等疾病主要表現為下腹隱痛、墜脹感，通常不會伴有大便習慣或大便性狀改變，除非這些炎症已經很重，波及到直腸壁，引起直腸功能異常，才會有消化道症狀。