複雜性熱驚厥經過系統對因治療和對症治療，雙方面入手術後會好起來，但相對來講好轉的機率和治癒的幾率不是很高。複雜性熱驚厥不會完全治癒因素有如下幾方面：

第一、起病的年齡相對較小，通常在兒童6-10歲較為普遍發生；

第二、驚厥時體溫多數為高度熱型，體溫在38.5-39.5℃最為常見；

第三、複雜性熱驚厥時，會出現侷限性的身體的主動，抽搐的時間通常持續在0.25-24小時之內，而且還會伴隨著腦電圖的異常。

因此複雜性熱驚厥的預後相對較差，而且還有1%-2%的可能性會轉化成癲癇。但是複雜性熱驚厥經過神經內科、腦外科共同系統治療，在初步發生驚厥時及早治療，對症、對因共同入手治療，複雜性熱驚厥的治癒率還是很高的。