高熱驚厥後有神經系統的後遺症、循環系統的後遺症、消化系統的後遺症和內分泌系統的後遺症，具體如下：

第一、高熱驚厥後最常見神經系統的後遺症，通常有抽搐、麻痺、顫抖、痙攣、神經衰弱、共濟失調、錐體系和錐體外系的副作用，還有失眠、健忘、多夢、神經衰弱、睡眠時相變淺等後遺症。

第二、常見高熱驚厥後的循環系統後遺症有心臟供血不全，易得心肌炎、心肌病、心臟瓣膜病等情況。

第三、高熱驚厥後的消化系統後遺症有消化吸收不良，易腹脹、腹瀉、便秘等情況。

第四、內分泌系統的後遺症有內分泌失調，女性會有卵巢功能早衰、月經不調等症狀。