肛周膿腫是在肛門周圍，也可能在肛緣，離肛門有一定距離的位置，距離肛門2cm、3cm、5cm都有可能。總而言之，肛周膿腫是在肛門周圍，最常見於直腸後深間隙、直腸後淺間隙、坐骨直腸間隙、骨盆直腸間隙，但是，這些間隙都是包圍著直腸和肛管，因此稱為肛周膿腫。

如果是與肛門不通的膿腫，不能稱為肛周膿腫，只能稱為癤子。肛周膿腫最重要的特點是與肛門相通，在肛門周圍有肛門後深間隙，也有淺間隙，兩側可能是坐骨直腸窩膿腫和骨盆直腸窩膿腫，也有皮下膿腫，即特別表淺，只有一層皮。