寶寶肛周膿腫反覆發作包括以下幾點原因：

1、新生兒在此時生長發育比較旺盛，體內雄性激素水平會出現一過性增高，過高激素可以使肛門周圍腺體發達、分泌旺盛，而肛腺在分泌過程中，一旦因為某種原因受阻會引發局部感染；

2、嬰幼兒大便次數較多，此時大便未成形，稀便容易積存在肛竇內，從而引發肛腺感染；

3、小兒肛門直腸局部免疫結構尚未發育成熟，當未注意局部清潔衛生，或患上可以引起抵抗能力下降的疾病，會打破肛周免疫屏障，引發肛周局部感染。

寶寶患肛周膿腫後家屬都因顧及手術未選擇根治手術，常選擇保守治療方法，例如採用消炎、喂服藥物、坐浴等保守治療方法治療，部分表淺肛周膿腫通過此類保守治療方法症狀可以好轉，但肛管內肛腺感染仍存在，即內口仍存在，遇刺激因素或寶寶免疫能力下降容易繼發引起感染。如果治療不及時會導致肛周膿腫出現反覆發作，膿腫破潰後形成肛瘻，不採取手術進行徹底根治會一直反覆發作，並且長久無法癒合，因此此類情況下稱之為肛瘻。