肛周膿腫一次切開引流找到內口後一次掛線解決兩個手術，和形成肛瘻後再做手術實際上一樣，只不過肛周膿腫根治術只是縮短手術時間，但手術選擇適應症存在嚴格要求。即肛周膿腫一定比較淺表，而且膿腫比較侷限、內口十分清晰，否則比較大的膿腫、感染性較強的膿腫，勉強一次性手術很容易損傷過多括約肌。肛周膿腫切開引流後傷口會排膿，會逐漸收縮，收縮以後形成的瘻管比較侷限，形似一條線。做手術可以減少周圍組織損傷，主要還是減少肛門括約肌的損傷。

肛瘻手術分兩次做也存在一定的道理，對於比較深、比較複雜的肛瘻，建議分兩次進行手術。手術並不存在非常大的區別，而對於縮短時間和手術適應症的選擇則十分值得考慮。