通常很少有肛門感染的診斷，肛門周圍感染一般比較常見，比如肛周膿腫、肛周皮下感染灶。首先根據症狀不同、表現不同考慮治療方案。如果是比較淺的感染灶、侷限的感染灶，可以通過藥物，比如抗生素或者消炎藥進行保守治療。如果範圍比較大，已經有明顯膿腔，而且又有全身症狀的情況下，必須考慮手術切開引流放膿，才能夠緩解症狀。

此外，還可出現部分特別的症狀，比如感染壞死性筋膜炎，為非常嚴重的肛門周圍感染性疾病，死亡率能達到75%。目前隨著診斷治療技術的提高、抗生素改進，死亡率較前存在大幅度下降，但是還是對生命有著非常大的威脅。如果出現壞死性筋膜炎感染，必須進行及時的手術治療。