小兒尿道下裂的費用與尿道下裂的類型、手術早晚有關，一般推薦學齡前是手術的最佳時機。

尿道下裂分4種類型，其中陰莖頭型、陰莖型行一期手術的成功率在90%左右，住院費用在2萬元左右。對於會陰型、陰囊型尿道下裂，由於尿道開口距龜頭較遠，需要取膀胱黏膜、頰黏膜及皮膚做尿道延長，這種手術難度較大，術後容易出現尿瘻、尿道狹窄等併發症。

有些患兒需要2次甚至多次手術，住院費用就會相對高，總體的住院費用應該在3-5萬元之間，有些孩子費用能夠到10萬元。