直腸息肉不論大小，都建議儘早手術切除。因現代醫學認為多數直腸惡性腫瘤是由直腸息肉發生發展而來，小息肉逐漸長大到一定程度會轉變為直腸惡性腫瘤。

手術切除術式需根據息肉大小確定，小的息肉可以經肛門局部切除或在腸鏡下切除，屬於微創手術，對身體影響不大，術後併發症相對較少且風險小、獲益大，可以從根源預防直腸癌的發生。直腸息肉屬於良性疾病，目前結腸鏡檢查、肛門鏡檢查和指檢能發現大部分直腸息肉。建議45歲以上的患者出現大便性狀改變時進行腸鏡檢查，以便於發現並切除結直腸息肉，切除的息肉需進行病理檢查。