如果腸鏡檢查發現直腸息肉，通常醫生會建議進行內鏡下切除，且切除方式通常需根據息肉大小、位置和數量決定。對於較小單發息肉而言，可通過內鏡下活檢鉗直接鉗除，或者是通過氬氣刀燒凝。對於較大息肉而言，可通過內鏡下黏膜切除術進行治療，即黏膜下注射生理鹽水將病變與肌層分開以後，用圈套器直接高頻電切除，避免損傷黏膜肌層。

此外，對於更大的息肉，可通過內鏡下黏膜剝離術治療，但由於此手術對內鏡操作醫生要求較高，故建議患者去大型醫院，找經驗豐富的醫生治療。