目前直腸息肉發病原因還不明確，一般認為跟炎症刺激，比如慢性結腸炎、慢性痢疾、血吸蟲病、腸結核等有關係，機械損傷和糞便刺激也是原因之一，有些甚至是由基因突變和遺傳因素引起。

酒對胃腸黏膜是一種刺激，會引起直腸黏膜充血、擴張，容易受糞便或者異物摩擦損傷，喝酒容易引發痔瘡等肛腸疾病，因此都勸朋友家人少吃辣椒、少飲酒。長期喝酒對直腸息肉有影響，尤其容易引起直腸息肉切除後復發，這在臨床上很多見，所以值得引起注意。