直腸息肉手術恢復後一般建議患者半年到1年複查，國外一般建議複查時間可能更長，2-3年不等，但直腸息肉一旦發生，標誌患者體質可能會再次發生息肉，包括直腸、結腸其它部位也可能有息肉存在。由於結腸鏡檢查無法每次檢查都能觀察100%的直腸和結腸黏膜，一般會有10%-20%的黏膜由於糞水遮蓋，腸道的角度較大，無法被完全觀察，故中國醫生一般較謹慎，建議患者複查時間較短，一般在半年到1年之內複查。
對於有惡變傾向或病理表現不明確的患者，一般醫生會提醒患者複查時間，患者應遵從醫囑，不要拖延，否則可能引發嚴重後果，比如息肉惡變、局部復發，導致需要進一步追加手術，或者變成惡性疾病，需要進一步的大手術治療。