就醫治療時，專科醫生根據患者的排便動作即可觀察患者脫出的組織是否為直腸或是直腸黏膜，臨床診斷相對較易。但直腸脫垂中有一種為直腸黏膜的內脫垂，出現內脫垂時確診相對較難，需要進一步做排便造影檢查進行下一步診斷。排便造影，與X射線檢查類似，檢查後會得到放射科醫生的診斷書，診斷書上對檢查結果會有詳細的說明。