甲狀腺乳頭狀癌生存率較高，根據美國梅奧醫學研究中心發現，根據甲狀腺癌大小、患者年齡以及腫物是否有遠處侵犯、是否切除乾淨等常規臨床指標，可以對腫物預後做出初步判斷。當腫物評分＜6分時，患者20年生存率可達99%；腫物評分為7-8分時，患者20年生存率仍然可為50%，甚至＞80%。

通常患者不是因為甲狀腺癌復發、轉移而影響預期壽命。甲狀腺癌診斷中，超聲最為重要，如果超聲提示存在惡性傾向，建議患者積極手術切除，只要將腫物完整切除，即便未進行淋巴結清掃，甚至患者出現淋巴結轉移，預後仍然較好。因此手術以後，只要積極定期複查，多數患者可以得到較好治療效果。