胃平滑肌瘤本身是良性疾病，但是現在真正的胃平滑肌瘤很少。在1983年之前，把胃的良性腫瘤稱為胃平滑肌瘤，惡性腫瘤叫平滑肌肉瘤或者神經鞘瘤、神經母細胞瘤等；到了1983年之後，這些疾病統一叫胃間質瘤。

胃間質瘤雖然是一大類的疾病，有偏良性、偏惡性情況，還有良惡性之間的腫瘤。胃平滑肌瘤治療實際上比較簡單，直接做局部切除即可，但是手術以後要根據腫瘤的大小、核分裂象等來判斷是偏良性還是偏惡性，有些偏惡性的腫瘤手術以後還要繼續口服靶向藥物進行治療。