胃平滑肌瘤是良性腫瘤，惡變率低，手術是主要的治療方式，手術切除率高，預後好。手術的選擇與腫瘤大小、數目、部位有關。胃平滑肌瘤有時難以與惡性腫瘤，即胃平滑肌肉瘤相鑑別，胃平滑肌瘤的手術一般選局部的廣泛切除，手術應切除距腫瘤邊緣2-3cm的正常胃壁組織，術中要做快速病檢。對疑有惡變者應做胃大部切除或全胃切除，5cm以上的腫塊有胃平滑肌肉瘤的可能，建議按惡性腫瘤來處理。胃平滑肌瘤術後很少復發，如果復發仍考慮再次手術。胃黏膜下直徑＜2cm的腫瘤，尤其帶蒂的胃平滑肌瘤，還可做胃鏡下電切除。