胃間質瘤的確診分為以下兩個方面：

1、手術以後確診：胃間質瘤術前的診斷上，現在常用的是腹盆腔影像學檢查和超聲胃鏡，影像學檢查包括CT和核磁，超聲胃鏡下看腫瘤生長層次，主要是跟胃癌相鑑別，兩個檢查都無法獲得病理組織，所以多數胃間質瘤患者手術之前無法確診，都是手術完整切除以後根據病理檢查確診是不是胃間質瘤，是胃間質瘤裡的低度危險組、中度危險組還是高危組；

2、暫時不適合手術的術前穿刺確診：在手術之前進行評估的時候，患者不適合手術，比如腫瘤的位置不好，有可能要做聯合臟器切除，要做非常大的手術，或者手術風險非常高，不建議Ⅰ期手術，可做超聲胃鏡下的穿刺活檢，或者經腹腔的穿刺活檢來獲得病理組織。穿刺活檢可以獲得病理組織對疾病進行確診，同時確診以後可以先採取相關的藥物治療，就是靶向治療，治療以後如果腫瘤縮小，可以再次做手術。