膽汁反流性胃炎主要以藥物治療為主，平時可以酌情食用蘇打餅乾以中和胃酸。但蘇打餅乾作用有限，僅能部分緩解患者疼痛。此外，還需避免煙、酒、咖啡、茶等刺激性食物。

患者出現腹脹、噯氣、噁心、嘔吐等症狀，主要與膽汁反性胃炎合併消化不良有關，主要依靠藥物治療，如助消化藥物消化酶，促進胃腸動力藥物，如嗎丁啉、莫沙必利，以及保護胃黏膜藥物，如替普瑞酮、邁之靈、康復新等。