膽汁反流性胃炎可以根治。患者多采用藥物治療，可使用甲氧氯普胺、多潘立酮、莫沙必利等促胃動力藥物，減少膽汁在胃內的停留時間，促進反流物的排空。使用鋁碳酸鎂等結合膽鹽類藥物，加速膽鹽及糞便排出，減少對胃黏膜損害。配合使用奧美拉唑、蘭索拉唑、雷貝拉唑等抑制胃酸藥，減少胃酸分泌。並且在患者有幽門螺桿菌感染時，應進行抗幽門螺桿菌治療，減少誘發癌變的可能，有利於疾病的恢復。