新生兒敗血症是新生兒期嚴重的感染性疾病，其發生可合併有神經系統的併發症，比如化腦會有嚴重的後遺症產生，如癲癇，運動、語言發育落後，或者視聽功能受到影響。短期敗血症可以引起多臟器損害，比如可以有合併有肺部感染、骨髓炎，短期後遺症主要是多臟器損害表現，比如引起肺部感染，出現呼吸困難、缺氧表現。

遠期後遺症，主要是神經系統的後遺症，最嚴重的有硬腦膜下積液、癲癇、視力障礙、聽覺障礙，還有運動功能障礙。新生兒敗血症的遠期後遺症主要是神經系統後遺症，比如合併有化腦，可能會引起腦積水、室管膜炎、硬膜下積液。如果治療不規範或耐藥菌治療效果不好，可能會產生視力障礙、聽覺障礙，以及語言、運動、智力發育落後，造成不同程度的損害。所以孩子出現感染，一定要早診斷，及早治療，爭取把後遺症降到最低。