先天性喉喘鳴能否自愈，主要取決於造成先天性喉喘鳴的病因。喉喘鳴主要為氣體通過阻塞的氣道而產生病理性的呼吸音疾病，如果是先天性的喉軟骨軟化及輕度氣道軟化，隨年齡增長、氣道發育能夠緩慢恢復，可達到自愈。

但聲帶麻痺、血管瘤甚至舌根囊腫，以及先天性腦脊膜膨出、氣管發育異常、腫瘤等，則需要進行呼吸內鏡檢查，必要時需要介入手術治療，才能得到滿意效果。