子宮右側附件囊腫的治療要取決於附件囊腫的原因，附件囊腫只是一個表現，目前導致形成附件囊腫的原因有以下幾種：

1、附件炎症，如果是附件炎症導致附件囊腫，如果持續存在、反覆發作，導致患者生活質量下降，可以考慮做囊腫局部切除；

2、如果不是炎症導致的附件囊腫，如是多囊卵巢綜合徵形成卵巢增大的表現，不算是真正意義上的囊腫，在手術治療上，可以考慮做腹腔鏡下的卵巢打孔；

3、如果是卵巢巧克力囊腫導致的附件區囊腫，可能需要進行卵巢巧克力囊腫的剝除手術；

4、卵巢的腫瘤，又分為良性腫瘤和惡性腫瘤。如果是良性的卵巢腫瘤，一般在手術方案選擇上，進行良性卵巢腫瘤的剔除手術。如果是惡性的卵巢腫瘤，就要進行卵巢癌的分期手術；

5、生理性卵巢囊腫的問題，如果是生理性的卵巢囊腫，一般不需要特殊處理，定期3個月複查一次。一般生理性的囊腫，在3-6個月都會自然消失，不需要進行任何處理。