子宮內膜異位症的表現之一就是不孕症，子宮內膜異位症的患者不孕率高達40%。子宮內膜異位症的患者可以妊娠，但相對困難，尤其是手術後的患者，卵巢功能可能會受損，要定期複查卵巢功能，及時監測，必要時儘早進行輔助生殖技術的助孕治療。

子宮內膜異位症如果位於卵巢，長期的侵蝕會影響卵巢功能，導致排卵障礙。子宮內膜異位症會導致盆腔局部微環境的改變，影響受精卵的結合，如果盆腔粘連嚴重，可能會影響受精卵的運輸，從而導致不孕。若患者已經確診為不孕症，並且與子宮內膜異位症相關，可以選擇手術治療或者是輔助生殖技術進行助孕治療。