腸胃紊亂大部分病人其實可以通過調整生活方式，或改變作息習慣，能夠達到腸胃的自身調節作用。很多人喜歡熬夜，喜歡飲食無規律，若通過改變基本的生活方式沒有好轉，也可以藉助藥物進行調節。

常見的藥物是益生菌類，因為腸道功能紊亂跟腸道菌群改變有關。其次可以吃胃腸黏膜修復藥物，或使用可以調節該方面疾病的中醫中藥，也有其優勢。如果確實沒有好轉，部分可能要藉助抗焦慮或抗抑鬱藥物輔助調節。腸胃功能紊亂發病率非常高，困擾很多患者。

現在經常講的身心共調即心身醫學，在該疾病的發病當中有不可替代的作用，所以還要強調心理治療在腸胃功能紊亂中的重要性。