臨床中部分子宮腺肌症患者可發生血清CA125水平增高，但CA125水平不是子宮腺肌症特異性標誌物。其他疾病如卵巢癌、子宮肌瘤或胃腸道腫瘤患者，均可以出現血清CA125增高現象。因此，不能單純依據血清CA125水平增高，而診斷患者為子宮腺肌症。

通常在子宮腺肌症治療、判斷預後及隨訪過程中，CA125屬於較為重要的指標，是輔助診斷子宮腺肌症較好的血清標誌物，但不屬於特異性表現。