女性三期梅毒症狀比較複雜，可以出現多器官的累及，比如皮膚、黏膜、骨關節以及各內臟、神經系統都可以受到損傷。此時體內的梅毒螺旋體雖少，但是破壞組織力比較強，經常會造成組織缺損和器官破壞。

首先患者表現為梅毒疹以及樹膠樣腫，即在頭部、肩部、背部以及四肢伸側出現銅赤色結節。如果出現了樹膠腫，結節表面還可以出現破潰，流出樹膠樣物質。一部分患者會侵犯心臟，導致梅毒性主動脈炎、梅毒性主動脈瓣關閉不全以及梅毒性主動脈瘤，有的患者侵犯神經會出現神經梅毒症狀。