小兒上呼吸道感染包括急性鼻咽炎、急性咽炎、急性扁桃體炎等。一般超過90%上呼道感染是由病毒感染引起，常見有鼻病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒、副流感病毒、腺病毒，以及腸道病毒等。對於嬰幼兒上呼吸道感染，要注意熱性驚厥，部分患兒甚至還會出現腸痙攣、腸繫膜淋巴結炎，表現為腹痛、進食不好等症狀。

另外，皰疹性咽峽炎也屬於上呼道感染，是由腸道病毒、柯薩奇病毒感染引起。一般發生在夏秋季，患兒表現為流口水、發燒、厭食。部分患者在軟顎部還可能有小皰疹，皰疹周圍有紅暈，在皰疹破潰以後有潰瘍。咽結合膜熱也屬於上呼吸道感染，是由腺病毒3型、7型引起，可以在人群聚集機構流行。患兒主要症狀為發熱、結膜和咽結膜炎症。