先心病在孕檢時可以查出來，先天性心臟病早發現的最好辦法是孕22-26周做胎兒超聲。胎兒心臟超聲可以發現絕大部分的先天性心臟病，但由於現有技術水平的限制，不是所有先天性心臟病都能被發現。

一般如房缺、室缺等常見的先心病以及單心室等嚴重的先心病，發現可能性更大。產前心臟超聲提前發現後可到專業的先心病外科醫生處諮詢，提前安排生產計劃和孩子出生以後的治療。