先心病分類方法較多，常見類型如下：

1、缺損：即兩個心房或兩個心室間出現異常通道，出現在房間隔的缺損稱為房缺，出現在室間隔的缺損稱為室缺；

2、梗阻：心臟內部或血管由於部分原因梗阻，如常見的肺動脈瓣狹窄是因為肺動脈瓣的三個瓣葉未能良好分離、發育，造成粘連，導致右室流出道到肺動脈之間的通道狹窄；

3、連接異常：最典型的情況是大血管錯位，即主動脈和肺動脈位置互換。主動脈本來應該從左室發出，肺動脈從右室發出，但異常情況下，主動脈從右室發出，肺動脈從左室發出。另外還有一種連接異常，如完全性肺靜脈異位引流，正常情況下人的四根肺靜脈都應該匯入到左心房，但此類異常情況中，肺靜脈可能最後彙總進入右心房或冠狀靜脈竇。