臨床各類型的先天性心臟病發病率不一，總體發病率約為0.5%-2%。

先天性心臟病可分為簡單性先天性心臟病及複雜性先天性心臟病。簡單性先天性心臟病患兒通過治療基本無法影響自身的生長發育、體力活動及自然壽命。

複雜性先天性心臟病可伴隨患兒終生，亦可引起心衰、心律失常等表現，且多次干預後仍無明顯效果，甚至面臨終身服藥的風險。因此建議進行妊娠期檢查，從而逐漸降低先天性心臟病，尤其是複雜性先天性心臟病的發病率。