嬰兒先天性心臟病的症狀，部分嬰兒並不特異，甚至沒有相關的臨床表現，僅在正常的體格檢查時，由醫生聽診發現心臟雜音，再進一步的完善心臟彩超，提示是有先天性心臟病。還有部分患有先天性心臟病的嬰兒，會有相關的臨床症狀，具體如下：

1、全身表現：常有餵養困難的表現，比如單次吸奶量會明顯減少，或吸奶的頻次可能會適當增加，還有可能會出現吸奶減弱或吸奶無力。還有個別嬰兒，可能會出現體重不增，甚至是出現體重的增長緩慢等；

2、局部心臟症狀：尤其是最常見的左向右分流型的先天性心臟病，因為這部分嬰兒肺血都增多，同時有可能合併免疫力低下，容易反覆的呼吸道感染，比如容易患氣管炎、肺炎，甚至有可能會發生呼吸衰竭，部分孩子有可能會出現夜間的哭鬧、大汗。還有部分發紺型的先天性心臟病，有可能會出現面色青紫、口唇發紺，甚至有可能會出現杵狀指等臨床表現。