臨床可根據患兒表現將先天性心臟病分為發紺型先天性心臟病與非發紺型先天性心臟病，此分類方法利用患者症狀特徵作為分類名稱組成部分，具體情況如下：

1、發紺型先天性心臟病因心臟內右向左分流，肺血減少或動靜脈血在心內混合所導致，如法洛四聯症、完全性大動脈轉位、重度肺動脈瓣狹窄、肺動脈閉鎖等；

2、非發紺型先天性心臟病則因心臟內左向右分流，肺血增多，從而導致左心繫統梗阻病變，如先天性心臟病、室間隔缺損、房間隔缺損、動脈導管未閉等。

先天性心臟病患者症狀並非一成不變，因此臨床症狀分型方法也存在缺陷。