臨床上根據患兒症狀表現將先天性心臟病分為發紺型先天性心臟病與非發紺型先天性心臟病，此分類方法利用患兒症狀特徵作為分類名稱組成部分，具體情況如下：

1、發紺型先天性心臟病因心臟內右向左分流，肺血減少或動靜脈血在心內混合所導致，從而引起患者出現發紺表現；

2、非發紺型先天性心臟病則因心臟內左向右分流，肺血增多，從而導致左心繫統梗阻病變。

上述先天性心臟病分類方法適用於非專業醫務人員及普通大眾，而專業心臟外科醫生需根據先天性心臟病節段解剖、病變分類、病變描述等三級系統進行專業分類。