甲母痣是在指甲覆蓋的甲母或甲床上，治療甲母痣需要打開表面覆蓋的指甲，充分暴露痣，將甲母和甲床上的皮損完整切除後縫合。

甲母痣手術後複發率低，但肉眼觀察皮損有侷限性，看不到散在的色素痣細胞，造成小部分甲母痣沒有徹底切除，新指甲上有黑斑，黑斑不斷地長寬，可考慮再次手術治療；甲母痣累及全部指甲，做完整切除即把整個甲母切除，不會再長出指甲。