法洛四聯症是一種複雜的青紫型先心病。手術有一定風險，風險性取決於法洛四聯症的疾病嚴重程度、肺血管發育情況，以及適合採用哪種手術方式。對於出生以後，就發生嚴重的青紫或者反覆缺氧發作，需要比較早的進行姑息手術治療的患兒，風險最大。無論進行右側改良的B-T分流手術，進行體血管、肺血管的分流手術，還是將右心室流出道通過補片進行疏通、不修補室間隔缺損的兩類姑息手術，手術以後的風險都非常大。因為牽扯到體循環和肺循環血量之間的平衡，所以手術以後的管理以及患兒的康復過程比較曲折，甚至有一定的死亡率。對於肺血管發育比較好的患兒，能夠進行根治手術的孩子也同樣存在風險。手術當中因為要進行右心室的切口，疏通右心室肥厚的肌肉，對於右心功能都是比較大的創傷。所以，即便能夠進行根治手術，沒有殘餘分流或者殘餘梗阻，也是對右心室功能創傷非常大的手術。由於手術過程當中，可能存在冠狀動脈分佈畸形，影響手術效果，也增加法洛四聯症手術風險。